Beim Schließen des Applikationsfensters kann das augenblickliche Layout gespeichert und beim nächsten Start wiedehergestellt werden. Dies geschieht im WorkbenchAdvisor der Applikation durch Überschreiben der Methode initialize

public class MyWorkbenchAdvisor extends WorkbenchAdvisor {

...

    @Override
    public void initialize(IWorkbenchConfigurer configurer) {
           configurer.setSaveAndRestore(true);
    }

}